STM32FC103CB是否可以在两个分区使用一个bin文件运行？

不能，因为你在生成的bin文件中包含了中断向量表，若是你使用的是Keil你可以修改一下Start

你可以将0x8000000修改一下再次生成bin文件，然后通过文本对比工具你就能发现在你生成的bin文件和填写的这个地址有关。
这样是做不到AB分区使用同一个bin文件分区升级的，因为AB分区中至少是有一个中断向量表不符合，若是每次的都是使用一个bin可以做到，但是以后你的程序发生改变，且此次升级的分区恰巧不是你在生成bin文件时所填写的地址的话就会升级失败。
可以使用单分区+USB，单分区升级，升级失败的话跳到USB程序，至少能保证还有升级的机会。